Il 12 novembre 1986 la Conferenza Episcopale Italiana riconosceva l’Istituto di Scienze Religiose della Diocesi di Concordia-Pordenone “Rufino di Concordia” in Portogruaro come abilitato a rilasciare titoli di qualificazione professionale per l’insegnamento della religione cattolica nelle scuole pubbliche.

A partire dall’anno accademico 1987-1988, l’Istituto Superiore di Scienze Religiose delle Venezie decideva, per volontà della Conferenza Episcopale Triveneta espressa in data 5 giugno 1987, di ripetere i suoi corsi in Portogruaro, visto il considerevole numero degli iscritti alla Sede di Padova e la difficoltà di accesso ad essa di una parte degli studenti.

Il 7 dicembre 1991, la Congregazione per l’Educazione Cattolica confermava l’Istituto Superiore di Scienze Religiose delle Venezie nelle sue diverse sedi “per un secondo quadriennio”, approvandone gli Statuti, e l’11 gennaio 1996 ne concedeva l’approvazione definitiva.

Con l‘anno accademico 2005-2006 ha preso avvio “ad experimentum” il primo anno dell’ISSR “Rufino di Concordia” della Diocesi di Concordia-Pordenone, secondo quanto indicato nella lettera della Conferenza Episcopale Italiana datata 4 ottobre 2005.

La Congregazione per l’Educazione Cattolica, il 23 marzo 2006, ha emanato il decreto di erezione dell’ISSR “Rufino di Concordia” di Portogruaro e ne ha approvato gli Statuti in data 27 luglio 2010.